Институт «Системной автоматизации и инноватики» образован в декабре 2008 года. Директор института – Воробьева Алла Викторовна, кандидат технических наук, профессор, почетный работник Высшего профессионального образования РФ, заведующая кафедрой высшей математики. Институт предоставляет своим студентам большие возможности для участия в научной работе с младших курсов. Этому способствует активная работа научных школ факультета и современное оснащение лабораторий кафедр.